Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C4orf33Q8N1A6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C4orf33Q8N1A6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4orf33Q8N1A6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C4orf33Q8N1A6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4orf33Q8N1A6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf33Q8N1A6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf33Q8N1A6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf33Q8N1A6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf33Q8N1A6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4orf33Q8N1A6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms