Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM9

SLC38A6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6Q8IZM9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A6Q8IZM9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A6Q8IZM9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC38A6Q8IZM9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC38A6Q8IZM9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A6Q8IZM9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms