Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CKAP2LQ8IYA6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CKAP2LQ8IYA6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CKAP2LQ8IYA6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CKAP2LQ8IYA6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CKAP2LQ8IYA6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CKAP2LQ8IYA6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms