Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC117Q8IWD4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC117Q8IWD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC117Q8IWD4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC117Q8IWD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC117Q8IWD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC117Q8IWD4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC117Q8IWD4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms