Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRLF3Q8IUI8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRLF3Q8IUI8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRLF3Q8IUI8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRLF3Q8IUI8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLF3Q8IUI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRLF3Q8IUI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLF3Q8IUI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLF3Q8IUI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms