Protein–RNA interactions for Protein: Q86VY9

TMEM200A, Transmembrane protein 200A, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200AQ86VY9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200AQ86VY9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200AQ86VY9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200AQ86VY9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM200AQ86VY9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM200AQ86VY9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM200AQ86VY9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms