Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACS2Q86VP3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACS2Q86VP3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACS2Q86VP3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACS2Q86VP3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACS2Q86VP3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACS2Q86VP3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACS2Q86VP3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms