Protein–RNA interactions for Protein: Q86UL3

GPAT4, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT4Q86UL3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAT4Q86UL3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT4Q86UL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPAT4Q86UL3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GPAT4Q86UL3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPAT4Q86UL3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms