Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINC00523Q86TU6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LINC00523Q86TU6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00523Q86TU6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00523Q86TU6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00523Q86TU6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINC00523Q86TU6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINC00523Q86TU6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms