Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NPM2Q86SE8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NPM2Q86SE8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NPM2Q86SE8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NPM2Q86SE8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NPM2Q86SE8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NPM2Q86SE8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms