Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OTUD6AQ7L8S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTUD6AQ7L8S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OTUD6AQ7L8S5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
OTUD6AQ7L8S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OTUD6AQ7L8S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OTUD6AQ7L8S5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTUD6AQ7L8S5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
OTUD6AQ7L8S5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms