Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0Q8

RHOU, Rho-related GTP-binding protein RhoU, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOUQ7L0Q8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOUQ7L0Q8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOUQ7L0Q8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOUQ7L0Q8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOUQ7L0Q8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOUQ7L0Q8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms