Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC80Q76M96 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC80Q76M96 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC80Q76M96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC80Q76M96 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC80Q76M96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC80Q76M96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms