Protein–RNA interactions for Protein: Q75T13

PGAP1, GPI inositol-deacylase, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP1Q75T13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP1Q75T13 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGAP1Q75T13 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGAP1Q75T13 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGAP1Q75T13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PGAP1Q75T13 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP1Q75T13 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP1Q75T13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP1Q75T13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGAP1Q75T13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGAP1Q75T13 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms