Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEM1Q6ZVN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEM1Q6ZVN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEM1Q6ZVN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEM1Q6ZVN7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEM1Q6ZVN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEM1Q6ZVN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms