Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UBR3Q6ZT12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBR3Q6ZT12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
UBR3Q6ZT12 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
UBR3Q6ZT12 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
UBR3Q6ZT12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
UBR3Q6ZT12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBR3Q6ZT12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBR3Q6ZT12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBR3Q6ZT12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBR3Q6ZT12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
UBR3Q6ZT12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
UBR3Q6ZT12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms