Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSZ5

ARHGEF18, Rho guanine nucleotide exchange factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGEF18Q6ZSZ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGEF18Q6ZSZ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGEF18Q6ZSZ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGEF18Q6ZSZ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms