Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA6Q6ZSJ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHISA6Q6ZSJ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA6Q6ZSJ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHISA6Q6ZSJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA6Q6ZSJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA6Q6ZSJ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA6Q6ZSJ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHISA6Q6ZSJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHISA6Q6ZSJ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA6Q6ZSJ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA6Q6ZSJ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms