Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.02■■■■■ 4.16
LRRC9Q6ZRR7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
LRRC9Q6ZRR7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
LRRC9Q6ZRR7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
LRRC9Q6ZRR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
LRRC9Q6ZRR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.94■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
LRRC9Q6ZRR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
LRRC9Q6ZRR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
LRRC9Q6ZRR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
LRRC9Q6ZRR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
LRRC9Q6ZRR7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
LRRC9Q6ZRR7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
LRRC9Q6ZRR7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms