Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL4Q6ZR62 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL4Q6ZR62 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTL4Q6ZR62 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTL4Q6ZR62 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL4Q6ZR62 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms