Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C16orf54Q6UWD8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C16orf54Q6UWD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C16orf54Q6UWD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C16orf54Q6UWD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms