Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AAGABQ6PD74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AAGABQ6PD74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AAGABQ6PD74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AAGABQ6PD74 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AAGABQ6PD74 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AAGABQ6PD74 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AAGABQ6PD74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AAGABQ6PD74 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AAGABQ6PD74 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms