Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LMOD2Q6P5Q4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LMOD2Q6P5Q4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LMOD2Q6P5Q4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LMOD2Q6P5Q4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LMOD2Q6P5Q4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMOD2Q6P5Q4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMOD2Q6P5Q4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LMOD2Q6P5Q4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
LMOD2Q6P5Q4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
LMOD2Q6P5Q4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms