Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL13AP3Q6NVV1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL13AP3Q6NVV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL13AP3Q6NVV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL13AP3Q6NVV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL13AP3Q6NVV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms