Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UFSP1Q6NVU6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UFSP1Q6NVU6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UFSP1Q6NVU6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UFSP1Q6NVU6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms