Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
REEP3Q6NUK4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REEP3Q6NUK4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REEP3Q6NUK4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REEP3Q6NUK4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
REEP3Q6NUK4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
REEP3Q6NUK4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 454.3 ms