Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC102BQ68D86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC102BQ68D86 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC102BQ68D86 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC102BQ68D86 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC102BQ68D86 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC102BQ68D86 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC102BQ68D86 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC102BQ68D86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC102BQ68D86 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms