Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNS3Q68CZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNS3Q68CZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TNS3Q68CZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNS3Q68CZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TNS3Q68CZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TNS3Q68CZ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TNS3Q68CZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNS3Q68CZ2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNS3Q68CZ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms