Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QL3Q5VWW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QL3Q5VWW1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QL3Q5VWW1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QL3Q5VWW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QL3Q5VWW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL3Q5VWW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms