Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TAF3Q5VWG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TAF3Q5VWG9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TAF3Q5VWG9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAF3Q5VWG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF3Q5VWG9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF3Q5VWG9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms