Protein–RNA interactions for Protein: Q5UCC4

EMC10, ER membrane protein complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC10Q5UCC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EMC10Q5UCC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EMC10Q5UCC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EMC10Q5UCC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMC10Q5UCC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMC10Q5UCC4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMC10Q5UCC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms