Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO4Q5TGY1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO4Q5TGY1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO4Q5TGY1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO4Q5TGY1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMCO4Q5TGY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMCO4Q5TGY1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms