Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF648Q5T619 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF648Q5T619 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF648Q5T619 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF648Q5T619 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF648Q5T619 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF648Q5T619 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms