Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZFYVE27Q5T4F4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZFYVE27Q5T4F4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.9 ms