Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMTC4Q5T4D3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMTC4Q5T4D3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMTC4Q5T4D3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC4Q5T4D3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMTC4Q5T4D3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMTC4Q5T4D3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms