Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COL5A1-AS1Q5SY13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms