Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGD3Q5JSP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD3Q5JSP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD3Q5JSP0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGD3Q5JSP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGD3Q5JSP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FGD3Q5JSP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms