Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PABPC1L2AQ5JQF8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC1L2AQ5JQF8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1L2AQ5JQF8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PABPC1L2AQ5JQF8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PABPC1L2AQ5JQF8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms