Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CDCA8Q53HL2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDCA8Q53HL2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDCA8Q53HL2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CDCA8Q53HL2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDCA8Q53HL2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDCA8Q53HL2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDCA8Q53HL2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CDCA8Q53HL2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CDCA8Q53HL2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CDCA8Q53HL2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDCA8Q53HL2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDCA8Q53HL2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDCA8Q53HL2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDCA8Q53HL2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CDCA8Q53HL2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms