Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5N1

ABCA11P, Putative ATP-binding cassette sub-family A member 11, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA11PQ4W5N1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCA11PQ4W5N1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCA11PQ4W5N1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCA11PQ4W5N1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCA11PQ4W5N1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCA11PQ4W5N1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms