Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MINDY4Q4G0A6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MINDY4Q4G0A6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MINDY4Q4G0A6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MINDY4Q4G0A6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MINDY4Q4G0A6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MINDY4Q4G0A6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms