Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT71Q3SY84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT71Q3SY84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT71Q3SY84 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT71Q3SY84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT71Q3SY84 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT71Q3SY84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT71Q3SY84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms