Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00303Q3SY05 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00303Q3SY05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00303Q3SY05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00303Q3SY05 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms