Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM12Q3MHD2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM12Q3MHD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LSM12Q3MHD2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM12Q3MHD2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM12Q3MHD2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM12Q3MHD2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms