Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP25-1Q3LHN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms