Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C15orf59Q2T9L4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C15orf59Q2T9L4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C15orf59Q2T9L4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C15orf59Q2T9L4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C15orf59Q2T9L4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms