Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWI5Q1ZZU3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWI5Q1ZZU3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SWI5Q1ZZU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SWI5Q1ZZU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWI5Q1ZZU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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