Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CA9Q16790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CA9Q16790 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CA9Q16790 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CA9Q16790 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CA9Q16790 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CA9Q16790 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CA9Q16790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CA9Q16790 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CA9Q16790 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CA9Q16790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CA9Q16790 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CA9Q16790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CA9Q16790 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA9Q16790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA9Q16790 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA9Q16790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CA9Q16790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CA9Q16790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CA9Q16790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CA9Q16790 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CA9Q16790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA9Q16790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA9Q16790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA9Q16790 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CA9Q16790 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CA9Q16790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CA9Q16790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CA9Q16790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CA9Q16790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CA9Q16790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA9Q16790 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA9Q16790 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA9Q16790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA9Q16790 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA9Q16790 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CA9Q16790 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CA9Q16790 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CA9Q16790 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CA9Q16790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CA9Q16790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CA9Q16790 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CA9Q16790 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA9Q16790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA9Q16790 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA9Q16790 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA9Q16790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CA9Q16790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CA9Q16790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CA9Q16790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CA9Q16790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CA9Q16790 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CA9Q16790 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CA9Q16790 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CA9Q16790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CA9Q16790 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CA9Q16790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CA9Q16790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA9Q16790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA9Q16790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA9Q16790 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA9Q16790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA9Q16790 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CA9Q16790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CA9Q16790 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CA9Q16790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CA9Q16790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CA9Q16790 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CA9Q16790 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CA9Q16790 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CA9Q16790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CA9Q16790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CA9Q16790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA9Q16790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA9Q16790 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA9Q16790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA9Q16790 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CA9Q16790 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CA9Q16790 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CA9Q16790 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA9Q16790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA9Q16790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
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