Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HIF1AQ16665 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIF1AQ16665 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIF1AQ16665 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HIF1AQ16665 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIF1AQ16665 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIF1AQ16665 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms