Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NREPQ16612 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NREPQ16612 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NREPQ16612 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NREPQ16612 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NREPQ16612 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NREPQ16612 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NREPQ16612 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NREPQ16612 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NREPQ16612 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NREPQ16612 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NREPQ16612 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NREPQ16612 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NREPQ16612 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NREPQ16612 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NREPQ16612 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NREPQ16612 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NREPQ16612 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NREPQ16612 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NREPQ16612 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NREPQ16612 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NREPQ16612 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NREPQ16612 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NREPQ16612 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NREPQ16612 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NREPQ16612 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NREPQ16612 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NREPQ16612 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NREPQ16612 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NREPQ16612 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NREPQ16612 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NREPQ16612 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NREPQ16612 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NREPQ16612 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NREPQ16612 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NREPQ16612 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NREPQ16612 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NREPQ16612 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NREPQ16612 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NREPQ16612 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NREPQ16612 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NREPQ16612 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NREPQ16612 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NREPQ16612 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NREPQ16612 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NREPQ16612 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NREPQ16612 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NREPQ16612 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NREPQ16612 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NREPQ16612 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NREPQ16612 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NREPQ16612 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NREPQ16612 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NREPQ16612 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NREPQ16612 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NREPQ16612 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NREPQ16612 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NREPQ16612 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NREPQ16612 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NREPQ16612 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NREPQ16612 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NREPQ16612 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NREPQ16612 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NREPQ16612 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NREPQ16612 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NREPQ16612 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NREPQ16612 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NREPQ16612 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NREPQ16612 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NREPQ16612 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NREPQ16612 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NREPQ16612 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NREPQ16612 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NREPQ16612 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NREPQ16612 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NREPQ16612 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NREPQ16612 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NREPQ16612 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NREPQ16612 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NREPQ16612 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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